MU69 es un binario de contacto bilobulado con una forma aplanada, unidades geológicas discretas y una notable heterogeneidad del albedo. Sin embargo, hay poco color superficial o heterogeneidad compositiva. No se detectó evidencia de satélites, anillos u otras estructuras de polvo o interacciones con el viento solar. El origen de MU69 parece ser consistente con el colapso de la nube de guijarros seguido de una fusión a baja velocidad de sus dos lóbulos.