A pesar de esta amplia cobertura financiera para sufragar una simple página web informativa y una revista de solo 4 números al año, en octubre de 2009 Cubaencuentro anunció el despido de toda su plantilla por falta de fondos. Las personas despedidas fundaron un nuevo proyecto digital –con la misma línea ideológica-, llamado Diario de Cuba que, desde su nacimiento, también ha sido sostenido por la AECID. Cubaencuentro se presenta actualmente a las convocatorias oficiales bajo el nombre de “Asociación Cuba: reflexión y análisis”.