Debido a su gran coste, tanto operativo como energético, la desalinización de agua de mar ha de considerarse como último de los recursos disponibles de obtener agua potable. Las plantas desalinizadoras obtienen la energía necesaria a partir de combustibles fósiles, con la consecuente aportación de gases contaminantes a la atmósfera. Además, la variación de concentración salina que provocarían en el agua de mar a su alrededor podría tener consecuencias nefastas para los ecosistemas.