#1 Estoy de acuerdo en lo de que el nuevo panel Compiz Settings no me gusta, pero también está el CompizConfig que no está tan mal.
En cuanto al gestor de ventanas, puedes poner el que quieras, simplemente puedes arrancarlo con compiz –replace metacity y comenzará con metacity y no con emerald.
Lo de que sea configurable creo que es una virtud, puedes activar los efectos que quieras o necesites en cada momento y configurarlos para que sean o parezcan distintos; y si no te convencen siempre tienes la opción de limpiar que te coloca los valores por defecto.
El artículo del que viene http://news.bbc.co.uk/hi/spanish/business/newsid_6945000/6945757.stm dice más claramente que el 80% se refiere a consumo de productos paralelos a la revista.