Las principales cepas de virus influenza A en humanos son H3N2 y H1N1 quedando a mucha distancia H5N1, H2N2 y H7N9. En aves, las principales cepas son H5N1 y H9N2 seguidas de H5N2, H3N8 y H4N6. En cerdos, además de H1N1 y H3N2 es frecuente H1N2. En perros y caballos, el principal tipo es H3N8. Se ofrecen tablas de la distribución de los distintos tipos de hemaglutinina (H) y neuraminidasa (N) por tiempo. Desde 2010 en Occidente predominan los subtipos de hemaglutinina H1.2c, H1.2d2c y H3.2b2.