#107 En la pestaña vídeo del Handbrake puedes elegir entre un slider de "calidad" (tamaño/calidad a ojo) y "avg. bitrate" (bitrate medio). Si le bajas el bitrate a la mitad del vídeo original el archivo resultante te pesará la mitad de tamaño, y así sucesivamente. Para una pantalla pequeña realmente no necesitas mucho bitrate.
Y sí, en el Handbrake sí que puedes cambiar el contenedor, pero solo entre MP4 (M4V realmente) y MKV. Para tabletas va mucho mejor el M4V.
#75 Si sólo quieres cambiar el contenedor (mp4 a mkv) puedes utilizar la aplicación gratuita MKVToolNix. Si quieres, además, recomprimir entonces tu respuesta es #95
Y sí, en el Handbrake sí que puedes cambiar el contenedor, pero solo entre MP4 (M4V realmente) y MKV. Para tabletas va mucho mejor el M4V.