La Audiencia Nacional española ha absuelto a los seis jóvenes de Hernani y Urnieta que fueron juzgados en el tribunal especial bajo la acusación de ser miembros de Segi. Los imputados denunciaron en el juicio haber sido víctimas de malos tratos y torturas durante la incomunicación policial e incluso algunos rechazaron que hubieran pertenecido a Segi. Ocho de ellos fueron detenidos en una operación policial el 31 de marzo de 2009, que Rubalcaba justificaba que «con esto se impiden sabotajes».