Estamos en la época de las -omicas lo que hablando de microorganismos viene a ser la microbiómica, y la metagenómica. Ya he hablado numerosas veces, por ejemplo aquí, de lo que estas disciplinas estudian...pero por si acaso lo resumo en pocas palabras. La metagenómica de un lugar es básicamente la secuenciación masiva de toda la información genética que existe en dicho sitio. La microbiómica consistiría en recoger todas las bacterias de cierto lugar y analizar toda la información genética (ARN 16s también, para taxonomía) que encontremos.