Partamos pues de una amplia cantidad de virus aislados de gripe, procedentes de pacientes diferentes, de varios puntos de un hemisferio de nuestro planeta. Pongamos que la vacuna que vamos a cocinar es la nuestra, y que por lo tanto estamos estudiando aislados en el hemisferio sur, en su invierno. Se secuencian las distintas cepas y un consejo especializado elige la mayoritaria, o la que consideran más peligrosa. Se miran las distintas mutaciones de la Hemaglutinina y Neuraminidasa (las famosas HA y NA ) y se decide que aislado se usará.