Un judío, nieto e hijo de condenados y condenado él mismo por la Santa Inquisición reposando a los pies del altar mayor de un templo católico, Zapata, atento a la corriente científica europea, introduce en España y prologa el Curso de Química de Nicolás Lemery, obra clave que marca el inicio de la química moderna. En 1700 funda en Sevilla la Regia Sociedad Médico-Química, la primera Real Academia española creada. Acosado por la inquisición, fue encerrado durante cuatro años por "judeizante" y confiscados la mitad de sus bienes.