Si bien las estructuras antes descritas presentan diferencias entre sí, todas poseen una característica común: la doble hélice, atributo que ha instaurado un paradigma sobre la estructura del ADN. Sin embargo, con el paso de los años esta visión ha ido perdiendo fuerza, a causa del descubrimiento de otras estructuras de DNA que se alejan de la clásica doble hélice. Algunas de estas estructuras son el Holliday junction, el G-triplex y el G-Quadruplex.