Geólogos del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) creen haber descubierto en las obras de Pajares evidencias de un antiguo casquete glaciar del continente Gondwana. Sin embargo, esta tesis es cuestionada por geólogos de la Universidad de Oviedo, que rechazan que los depósitos procedentes de las obras de los túneles del AVE de Pajares evidencien la presencia de los primeros valles glaciares en León y Asturias, como así lo defienden los científicos del CSIC.